מטרת הניתוח היא טיפול בדלקת חניכיים (פריודונטיטיס) שאינה מגיבה או שלא חל בה שיפור בטיפול אחר, בעיה כמו שורש שן חשוף, "כיסים", מנגנון אחיזה פגוע של השן וכו’…
ניתוח חניכיים נעשה לרוב תחת הרדמה מקומית בלבד, אך הרדמה כללית היא גם אפשרות שיכולה לבוא בחשבון אם המטופל מעוניין בכך או שקיימת בעיה אחרת שהרדמה כללית יכולה למנוע אותה.
צילום שיניים, צילום פנורמי או CT של הפה הם הכנה חובה לפני ניתוחי חניכיים מסוג זה.
בדרך כלל הניתוחים הללו פשוטים לאנשים בריאים, אך מטופלים בעלי סיכון מוגבר לפיתוח דלקת או בעיות קרישה חייבים ליידע את הרופא המנתח כדי לקבל טיפול אנטיביוטי מונע או לוודא קרישת דם טובה מספיק כדי לבצע את הניתוח.
